Yaware.TimeTracker учитывает только время работы в активной вкладке. То есть, сервис фиксирует то, на чем в данный момент сфокусировано Ваше внимание.
У вас может быть запущен проигрыватель в фоне, но если Вы работаете в другой программе, то будет учитываться время именно время работы в ней.